Kuys, J. A. E.  (2020).  Secular Chapters in the Diocese of Utrecht from 1295 until the Reformation. In M.  Carnier & Meijns, B. L. I. (Red.), De canonicis qui seculares dicuntur. Treize siècles de chapitres séculiers dans les anciens Pays-Bas. Thirteen Centuries of Chapters of Secular Canons in the Low Countries (Vol. 105, pp. 71-95). Turnhout: Brepols.

Kuys, J. A. E.  (2017).  Een band van eeuwen: de heilige Stefanus en Nijmegen. In H.  Peterse, Rooker, E., Camps, R., & Emmens, K. (Red.), De Stevenskerk. 750 jaar spiegel van Nijmegen (pp. 259-265). Nijmegen: Vantilt.

Kuys, J. A. E.  (2017).  Het kapittel: tot luister van de Stevenskerk, de stad en haar inwoners. In H.  Peterse, Rooker, E., Camps, R., & Emmens, K. (Red.), De Stevenskerk. 750 jaar spiegel van Nijmegen (pp. 181-193). Nijmegen: Vantilt.

Kuys, J. A. E.  (2017).  Ontstaan en ontwikkeling tot stedelijke parochiekerk. In H.  Peterse, Rooker, E., Camps, R., & Emmens, K. (Red.), De Stevenskerk. 750 jaar spiegel van Nijmegen (pp. 11-17). Nijmegen: Vantilt.

Kuys, J. A. E.  (2017).  Tableau van een hofhouding. Het testament van hertogin Catharina van Beieren (3 november 1400). Bijdragen en Mededelingen Gelre, 108, 63-89.

Kuys, J. A. E.  (2017).  Veranderende kerkelijke en politieke omstandigheden in de zestiende eeuw. In H.  Peterse, Rooker, E., Camps, R., & Emmens, K. (Red.), De Stevenskerk. 750 jaar spiegel van Nijmegen (pp. 195-1899). Nijmegen: Vantilt.

Kuys, J. A. E.  (2016).  Één hertog, vier bisschoppen. Bisdomgrenzen en het territorium van Gelre ca. 300-1600. In D.  Verhoeven, Gubbels, M., Wingens, M., & van den Bergh, S. (Red.), Gelderland grensland 2000 jaar verdeeld en verbonden (pp. 30-39). Nijmegen: Vantilt.

Kuys, J. A. E.  (2015).  De laatmiddeleeuwse parochie als bedreigde inkomstenbron: Anrhemse pastoors als bewakers van hun belangen ten opzichte van kapellen en kloosters. Bijdragen en Mededelingen. Historisch Jaaerboek voor Gelderland, 106, 111-134.

Kuys, J. A. E.  (2014).  Repertorium van collegiale kapittels in het middeleeuwse bisdom Utrecht. Middeleeuwse studies en bronnen (Vol. 148, p. 447+cd-rom). Hilversum: Verloren.

Kuys, J. A. E.  (2014).  Vrijgesteld maar vaak ook niet. Belasting op kerkelijke inkomens in het laatmiddeleeuwse bisdom Utrecht. De Vrije Fries, 94, 147-164.

Kuys, J. A. E.  (2011).  Forced vocation or not? The case of the Abducted Poor Clare of Wamel (1464). Franciscan Studies, 69, 387-402.

Schepers, K.  (2011).  Het mystieke leven van de zusters Agnieten. In H.  Kienhorst & Kuys, J. A. E. (Red.), Een verborgen leven: Arnhemse mystiek in de zestiende eeuw (pp. 135-150). Arnhem-Nijmegen: Historisch Museum Arnhem-Stichting Nijmeegse Kunsthistorische Studies.

Kuys, J. A. E.  (2010).  Schulden en studiebeurzen. Kardinaal Niccolò Capocci en zijn nalatenschap in het bisdom Utrecht. In G. B. J.  Elias, Smit-Buit, W., Ummels, H. A. M., & van Woerden, A. C. (Red.), Veluwse en andere geschiedenissen. Liber amicorum drs. R.M. Kemperink (pp. 59-71). Hilversum: Verloren.

Kuys, J. A. E.  (2010).  Zicht op klerikale rijkdom en armoede? De Zeeuwse geestelijke stand als belastingbetaler in de rekeningen van de geestelijke subsidie van 1532. In M.  Gubbels & Jansen, C. J. H. (Red.), Regio. Rechtshistorische opstellen aangeboden aan dr. P.P.J.L. van Peteghem (Vol. 53, pp. 105-124). Nijmegen: Gerard Noodt Instituut.

Kuys, J. A. E.  (2009).  Het ontstaan van stedelijke zeggenschap over de pastoorsbenoeming in de late middeleeuwen. De 'verstedelijking' van het pastoorsambt in Kampen. Overijsselse historische bijdragen, 124, 37-64.

Kuys, J. A. E.  (2008).  Het kapittel in de Pancratiuskapel op kasteel Ter Horst: geestelijken verbonden aan een bisschoppelijke burcht. In J.  Vredenberg (Red.), Geschiedenis van Rhenen (pp. 94-101). Utrecht: Matrijs.

Kuys, J. A. E.  (2006).  Weltliche Funktionen spätmittelalterlicher Pfarrkirchen in den nördlichen Niederlanden. In P.  Trio & De Smet, M. (Red.), The use and abuse of sacred places in late medieval towns  (Vol. 38, pp. 27-45). Leuven: Leuven University Press.

Kuys, J. A. E.  (2004).  Kerkelijke organisatie in het middeleeuwse bisdom Utrecht (p. 292). Nijmegen: Valkhof Pers.

Kuys, J. A. E.  (2001).  Aflaat en waterstaat. Bekommerde paus Leo X zich om de toestand van de Nederlandse zeedijken?. Tijdschrift voor Waterstaatsgeschiedenis, 10, 43-47.

Kuys, J. A. E.  (1998).  Kerk en godsdienstig leven in de middeleeuwse Noordelijke Nederlanden. Trajecta, 7, 273-295.

Kuys, J. A. E.  (1996).  Sweder van Kervenhem, proost van Zutphen. Een geestelijke in dienst van Karel van Gelre en Karel V (1526-1547). Bijdragen en Mededelingen Gelre, 87, 32-49.